، جلد ۱۷، شماره ۳، صفحات ۱۵۵-۱۵۹
عنوان فارسی غربالگری منطقه جزئی کد کننده ژن ایزوفرم-۲ متالوتیونین در گاو کوهان‌دار
چکیده فارسی مقاله متالوتیونین به دلیل عملکرد خود در اتصال محکم به فلزات سنگین در کاهش سمیت آن‌ها مهم می‌باشد. DNA از 30 گاو کوهان‌دار در معرض فلز سمی و 30 گاو بدون مواجهه با فلز سمی جدا شد. محصول تکثیر شده واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ایزوفرم-2 متالوتیونین (MT-2) ‌(bp 489) برای PCR-RFLP و تعیین توالی DNA مورد استفاده قرار گرفت. PCR-RFLP MP-2 TaqI ژنوتیپ هموزیگوت (AA) به جز حیوان E23 (AB) را تایید نمود. فراوانی ژنوتیپ AA و AB (E23) در گروه‌های مواجهه به ترتیب 967/0 و 033/0 بود. تعیین توالی DNA برای نمونه در معرض فلز سمی (E23) و نمونه گروه کنترل (C13) انجام شد. سپس مقایسه‌های BLAST توالی‌ها مقابل پایگاه داده‌های توالی نوکلئوتیدی هم تراز شدند که 150 جایگزینی نوکلئوتیدی شامل 70 جایگزینی همجنس و حدود 80 جایگزینی ناهمجنس را تایید نمود. PCR-RFLP متعاقب تعیین توالی DNA برای MT-2‌ تعداد بیشتری از جایگزینی‌های نوکلئوتیدی (150) برای ژنوتیپ AB را در مقایسه با ژنوتیپ AA (38) E21 تایید کرد. نسبت‌های جهش‌های متقاطع یا ناهمجنس در ژنوتیپ AB در مقایسه با ژنوتیپ AA MT-2 بیشتر بودند. تعیین توالی DNA برای E21 و C13 بر اساس نمونه‌گیری تصادفی انجام شد. آنالیز هم ترازی نمونه E21 و C13، 38 جایگزینی نوکلئوتیدی شامل تعداد مساوی جایگزینی‌های همجنس و ناهمجنس را تایید کرد. آنالیز BLAST توالی جزئی شناسایی شده 89% شباهت با Bos tarsus، 85% شباهت با گوسفند، 98% شباهت با بوفالو و 100% شباهت با توالی MT-2 بز را تایید نمود. یافته‌های کلی مطالعه حاضر تنوع توالی DNA در قطعه کد کننده ژن MT-2 گاو کوهان‌دار را تایید کردند که می‌تواند برای تعیین مشخصات و شناسایی شاخص‌هایی برای هومئوستاز فلز سنگین در گاو کوهان‌دار مورد استفاده قرار گیرد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Screening the partial coding region of metallothionein isoform-2 gene in Zebu cattle
چکیده انگلیسی مقاله Metallothionein (MT) is important because it binds tightly to heavy metals to decrease their toxicity. DNA was isolated from 30 toxic metal exposed and 30 toxic metal unexposed Zebu cows. The amplified metallothionein isoform-2 (MT-2) PCR product (489 bp) was further used for PCR-RFLP and DNA sequencing. MT-2 TaqI PCR-RFLP revealed homozygous genotype (AA) except for the E23 animal (AB). The genotype frequency of AA and AB (E23) genotypes in the exposed groups was 0.967 and 0.033 respectively. DNA sequencing was carried out for the toxic metal exposed sample (E23) and the control group sample (C13). Blast comparisons of the sequences were then aligned against a nucleotide database which revealed 150 nucleotide substitutions consisting of 70 transitions and around 80 transversions. DNA sequencing followed by PCR-RFLP for MT-2 revealed a higher number of nucleotide substitutions (150) for the AB genotype of E23 as compared to the AA genotype (38) of E21. The proportions of transversion mutations in the AB genotype were higher as compared to the MT-2 AA genotype. DNA sequencing was carried out based on random sampling for E21 and C13. Alignment analysis of the E21 and C13 sample revealed 38 nucleotide substitutions consisting of equal numbers of transition and transversion. BLAST analysis of the identified partial sequence revealed 89% identity with Bos taurus, 85% identity with sheep, 98% identity with buffalos and 100% identity with goat MT-2 sequences. Overall findings of the present study revealed DNA sequence variation in the coding region of the MT-2 gene of Zebu cattle which can be utilised to characterize and explore markers for heavy metal homeostasis in Zebu cattle.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله p n gholap | p n
mvsc, department of animal genetics and breeding, nagpur veterinary college, maharashtra animal and fishery sciences university mafsu , seminary hills, nagpur-440006, maharashtra state, india

d s کله | d s
department of animal genetics and breeding, nagpur veterinary college, maharashtra animal and fishery sciences university mafsu , seminary hills, nagpur-440006, maharashtra state, india

k krishnamurthi |
3environmental health division, national environmental engineering research institute neeri , nehru marg, nagpur-440020, maharashtra state, india

علیرضا sirothia | a r
department of animal genetics and breeding, nagpur veterinary college, maharashtra animal and fishery sciences university mafsu , seminary hills, nagpur-440006, maharashtra state, india

م دیوید kothekar | m d
department of animal genetics and breeding, nagpur veterinary college, maharashtra animal and fishery sciences university mafsu , seminary hills, nagpur-440006, maharashtra state, india

نشانی اینترنتی http://ijvr.shirazu.ac.ir/article_3807_e5962d2722840baa5476cb0688c113ae.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات