|
|
، جلد ۱۵، شماره ۳، صفحات ۲۱۸-۲۲۲
|
|
|
| عنوان فارسی |
آنالیز توالی ژن VP۱ در سه جدایه ایرانی ویروس فوق حاد بیماری بورس عفونی |
|
| چکیده فارسی مقاله |
بیماری بورس عفونی (IBD) در زمره بیماری‌های بسیار واگیردار ماکیان‌ها می‌باشد که توسط ویروس IBD (IBDV) ایجاد می‌شود. هدف از این مطالعه بررسی خصوصیات سه جدایه ایرانی ویروس فوق حاد IBD بود. با استفاده از RT-PCR، یک قطعه 715 جفت بازی در ژن VP1 سه سویه ایرانی IBDV تکثیر، تعیین توالی، و با سویه‌های IBDV موجود در بانک ژن مورد مقایسه، و ارتباطات فیلوژنتیک آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت. در برازش توالی نوکلئوتیدی سویه‌های IBDV، تعداد 23 اختلاف نوکلئوتیدی بین سویه‌های فوق حاد (به جز IL و PT) و بقیه سویه‌های غیر فوق حاد مشاهده شد. تعداد 2 جایگاه نوکلئوتیدی، 863G و 1023A، اختصاصی سویه‌های JRMP07IR و JRMP14IR بودند. همه سویه‌های فوق حاد (به جز IL و PT) در جایگاه‌های اسید آمینه 242E و 287A با سویه‌های غیر فوق حاد متفاوت بودند. در سه سویه ایرانی این مطالعه، جایگاه‌های اسید آمینه 251R در هر دو سویه JRMP07IR و JRMP14IR و 360L در JRMP14IR از بقیه سویه‌های فوق حاد متفاوت بودند. در آنالیز فیلوژنتیک، سه سویه ایرانی در کنار سویه‌های فوق حاد قرار گرفتند. سویه ایرانی، JRMP30IR، به دو سویه اروپایی HOL) و (UK661 و دو سویه جنوب شرق آسیا OKYM) و (ZJ2000، بیشتر نزدیک بود. اما دو سویه دیگر ایرانی، JRMP07IR و JRMP14IR، به دو سویه ترکیه‌ای OA/G1) و (OE/G2 و یک سویه مالزیایی (UPM94) نزدیک‌تر بودند. مطالعات گسترده‌تر در این زمینه دانش بیشتری در خصوص توزیع، تنوع، و ارتباطات فیلوژنتیک سویه‌های IBDV جدا شده در ایران و دیگر نقاط جهان برای پژوهشگران فراهم خواهد نمود. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
Sequence analysis of the VP1 gene in three very virulent Iranian infectious bursal disease virus strains |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Infectious bursal disease (IBD) is a highly contagious disease of chickens caused by the infectious bursal disease virus (IBDV). This study was conducted to characterize three IBDV strains from Iran. A reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) procedure was used to amplify a 715-bp fragment of the VP1 gene from IBDV strains. Amplified VP1 fragments of the three Iranian IBDV strains were sequenced and compared with published sequences of IBDV strains from around the world, and their phylogenetic relationships were analyzed. Alignment of IBDV strains revealed 23 nucleotide differences between vvIBDV (except for IL and PT) and other non-vvIBDV strains. Two nucleotide positions, 863G and 1023A, were specific as JRMP07IR and JRMP14IR strains. All vvIBDVs differed (except for IL and PT strains) from non-vvIBDVs at aa (amino acids) positions 242E and 287A. In the three Iranian IBDV strains, aa positions 251R in both JRMP07IR and JRMP14IR, and 360L in JRMP14IR differed from those of other vvIBDVs. In phylogenetic analyses, all three Iranian strains clustered together with vvIBDVs. One Iranian strain,JRMP30IR, was more closely related to two European strains (HOL and UK661) and two south-east Asian strains (OKYM and ZJ2000). However, the other two Iranian strains, JRMP07IR and JRMP14IR, were closer to two Turkish strains (OA/G1 and OE/G2) and a Malaysian strain (UPM94). Further comprehensive investigations will provide researchers a better knowledge on the distribution, variability, and phylogenetic relationships of different IBDVs isolated in Iran and other parts of the world. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
a غنی یی |
department of avian diseases, faculty of veterinary medicine, university of tehran, tehran, iran
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تهران (Tehran university)
سید محمد پیغمبری | s m
department of avian diseases, faculty of veterinary medicine, university of tehran, tehran, iran
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تهران (Tehran university)
j رزم یار |
department of clinical sciences, faculty of veterinary medicine, ferdowsi university of mashhad, mashhad, iran
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه فردوسی (Ferdowsi university)
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://ijvr.shirazu.ac.ir/article_2529_08be5f5a36bb78c91842b83f28121770.pdf |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
|
| نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|