، جلد ۱۶، شماره ۵، صفحات ۴۹-۵۷
عنوان فارسی تشخیص سریع مایکوباکتریوم های مقاوم به ریفامپین با استفاده از Real-time PCR
چکیده فارسی مقاله زمینه و هدف: مقاومت دارویی در مایکو باکتریوم توبرکلوزیس یکی از نگرانی‎های جدی می‎باشد که محققان و پزشکان با آن مواجه هستد. شناسایی سریع توبرکلوزیس‎های مقاوم به منظور شروع بی‎درنگ و مناسب درمان با داروهای خط دوم ضروری می‎باشد. این امر منجر به افزایش بازده درمان و جلوگیری موثر از انتقال وگسترش این بیماری مسری خواهد شد. هدف از این مطالعه طراحی روشی مبتنی بر Real-Time PCR جهت تشخیص موتاسیون‎های موجود در ناحیه RRDR ژن rpoB که منجر به مقاومت به ریفامپین در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس می‎شوند. مواد و روش‎ها: در این مطالعه تجربی پرایمر و پروپ توسط نرم افزارهای اختصاصی برای ناحیه RRDR ژن rpoB به منظور شناسایی جهش طراحی شد. برای ارزیابی حساسیت و ویژگی کلینیکی واکنش از نمونه‎های بالینی استفاده شد که پیش از این مقاومت و حساسیت آنها به وسیله تست حساسیت دارویی تناسبی تعیین شده بود. یافته‎ها: با استفاده از 40 نمونه بالینی(20 سویه حساس و 20 سویه مقاوم) حساسیت پروب استفاده شده برای تشخیص موتاسیون در کدون 526 و 531 معادل100 درصد در نظر گرفته شد. پرایمر و پروب‎های طراحی شده تنها به ناحیه اختصاصی RRDR ژن rpoB مایکوباکتریوم توبرکلوزیس متصل می‎گردند و مطالعات بیوانفورماتیکی هیچ گونه واکنش متقاطعی با ژنوم سایر میکرو ارگانیسم‎ها و انسان نشان ندادند. ویژگی بالینی روش راه اندازی شده به طور تجربی و با بررسی 25 نمونه منفی مورد آزمایش قرار گرفت و معادل 100 درصد در نظر گرفته شد. نتیجه گیری: روش Real-time PCR راه اندازی شده به علت سرعت و حساسیت بالا می‎تواند به عنوان ابزاری مفید وکارا در تشخیص سریع مایکوباکتریوم‎های مقاوم به ریفامپین در نظر گرفته شود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله هایب پروب، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، مقاومت به ریفامپین، ژن rpoB
عنوان انگلیسی Application of Real–Time PCR for Rapid Detection of Rifampicin Resistant Mycobacterium Tuberculosis
چکیده انگلیسی مقاله Background: The emergence of drug-resistant strain of M.tuberculosis is one of the most critical issues facing TB researchers and clinicians. Rapid diagnosis of drug-resistant tuberculosis is essential for the prompt initiation of effective second-line therapy to improve treatment outcome and limit transmission of this obstinate disease. The aim of this study is to develop a Real-time PCR assay for the detection of mutations in RRDR (rifampcin resistance determinant region) of rpoB which conferring rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis. Materials and Methods: In this experimental study, the primer and probe set were designed for a RRDR region of rpoB gene using a specialized software. Clinical specimens that had previously been evaluated resistant or sensitive by using convential method, were used for assessing the clinical sensitivity and specificity of the assay. Results: The clinical sensitivity of the assay was determined 100%. The primers and the probes were rpoB specific and no cross-reaction was observed with other microorganisms and human genome bioinformatically. The clinical specificity of developed Real-time PCR assay was examined experimentally using 25 negative samples and determined to be 100%. Conclusion: The developed real-time PCR assay can be used as an appropriate and efficient tool for the rapid detection of rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله بهناز طاهری | Behnaz Taheri
Department of Biotechnology and Microbiology, Faculty of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran
گروه بیوتکنولوژی و میکروبیولوژی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران

سیامک سمیعی | Siyamak Samiee
Food and Drug Laboratory Research Center, Ministry of Health and Medical Education, Tehran, Iran
مرکز تحقیقات آزمایشگاهی غذا و دارو، وزارت بهداشت و درمان و آموزش پزشکی، تهران، ایران

مهدی پریان | Mehdi Paryan
Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
گروه بیوتکنولوژی پزشکی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران

احسان اله غزنوی راد | Ehsanollah Ghaznavi-Rad
Department of Microbiology, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran
گروه میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران

نشانی اینترنتی http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-49-3&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/2736/article-2736-2049006.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده عفونی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی اصیل
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات