|
|
، جلد ۱۱، شماره ۳، صفحات ۱-۷
|
|
|
| عنوان فارسی |
بهینه سازی روش زنجیرهای پلی مرآز در تشخیص آلودگی آب به کلی فرم |
|
| چکیده فارسی مقاله |
چکیده مقدمه: در تشخیص عوامل میکروبی با استفاده از روشهای ملکولی، تخلیص کروموزوم مرحله بسیار مهمی است. در این تحقیق با افزایش مدت زمان مرحله دناتوراسیون بدون تخلیص کروموزوم باکتری، با تخریب سلول، تکثیر DNA انجام میشود. روش کار: در این مطالعه تجربی، رقتهای100/8 ، 100/4 ، 100/2 ، 100/1 ، 200/1 ، 400/1 ، 800/1 و 1600/1 از باکتری در آب مقطر تهیه گردید. پس از آن باکتریها به روش فیلتراسیون از نمونه جدا گردید. بدون خالص سازی کروموزوم باکتری، با استفاده از روش زنجیرهای پلی مرآز و به کمک پرایمرهای طراحی شده، ژن 16sRNA تکثیر یافت. شناسایی آلودگی 15 حلقه چاه آب شهر اراک و مقایسه آن با روش MPN جهت بررسی حساسیت روش فوق انجام گرفت. نتایج: کشت رقتهای تهیه شده نشان دهندۀ تأیید تعداد باکتریها در این رقتها بود. نتیجه واکنش زنجیرهای پلی مرآز رقتها (پس از فیلتراسیون) نشان داد که این سیستم قادر است وجود باکتری در این رقتها را شناسایی کند. علاوه بر آن مقایسه تشخیص آلودگی آب به دو روش MPN وPCR انجام گرفته در این تحقیق، نشان دهنده حساسیت بالای روش اخیر بود. نتیجه گیری: نتایج به دست آمده از این بررسی حاکی از آن است که با روش مذکور علاوه بر این که امکان بروز نتیجه منفی کاذب کمتر میشود نیاز به انجام مراحل سخت، پیچیده و وقت گیر تخلیص کروموزم نیز نمی باشد. |
|
| کلیدواژههای فارسی مقاله |
واکنش زنجیره ای پلی مرآز، آلودگی میکروبی آب، کلی فرم، تشخیص |
|
| عنوان انگلیسی |
Improvement of PCR in detection of coliform in water pollution |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background: In molecular diagnosis of microbial agent, purification of chromosome is very important step. In this study, after cell destruction, DNA replication was done by increasing the denaturation time, without DNA purification. Methods and Materials: In this experimental study eight different dilution of E.coli (8/100, 4/100, 2/100, 1/100, 1/200, 1/400, 1/800 and 1/1600) solution were madce in D.W, Bacteria were separated by filtration. Polymerase chain reaction method was used to propagate 162 rRNA gene by design primers without DNA Purification. In order to confirme sensitivity of PCR, contamination of 15 different sources of Arak well water wafer was compared by MPN method. For confirmed sensitivity of PCR, 15 sources of water in Arak were examined and compared with MPN method. Results: Present of bacteria in diution sou tion were confirmed by culture. Polymerale Chain reaction (PCR) data were shown this method is able to recognize bacteria in above dilutions after filtration. This study showed high sensitivity of PCR method in compare to MPN method. Conclusion: Results were shown without stages of extraction of DNA, PCR were done without losing chromosome. Therefore false negative results were decrease and avoided from difficult phases. |
|
| کلیدواژههای انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
حمید ابطحی | Hamid Abtahi
محمد جواد قناد زاده | Mohammadjavad Ghannadzadeh
علی هاتف سلمانیان | Ali hatef Salmanian
احسان غزنوی راد | Ehsan Ghaznavi Rad
مسعود کریمی | Masoud Karimi
ندا مولائی | Neda Molaei
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-33-2&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/2736/article-2736-2049452.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
عمومی |
| نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|