|
|
مجله دانشگاه علوم پزشکی قم، جلد ۱۰، شماره ۱۰، صفحات ۲۵-۳۳
|
|
|
| عنوان فارسی |
طراحی و بهینه‌سازی تست PCR برای تشخیص سریع پاتوتایپ‌های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی |
|
| چکیده فارسی مقاله |
زمینه و هدف: اشرشیاکلی به‌عنوان یکی از مهم‌ترین عوامل ایجادکننده بیماری اسهالی حاد در دنیا مطرح است. بیماری‌های اسهالی یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان کودکان کشورهای درحال توسعه می‌باشند. این مطالعه با هدف توسعه تکنیک PCR برای تشخیص اختصاصی ژن‌های ویرولانس پاتوتایپ‌های انترتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی (ETEC) و انترواگریگیتیو و اشرشیاکلی (EAEC) انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه برای تشخیص پاتوتایپ‌ها ETEC-EAEC، از ژن‌های اختصاصی st و lt (برای تشخیص پاتوتایپ ETEC) و از ژن اختصاصی aafII (برای شناسایی پاتوتایپ EAEC) استفاده شد. این تکنیک PCR برای این سه ژن طراحی و بهینه گردید. محصولات واکنش برای هریک از این ژن‌ها، در وکتور pTZ57R/T به‌عنوان کنترل مثبت، کلون و مورد استفاده قرار گرفت. میزان حساسیت پرایمر‌ها با محاسبه کمترین میزان تشخیص (Limit of Detection) و استفاده از ژنوم سایر باکتری‌ها به‌عنوان بررسی اختصاصیت پرایمر‌ها ارزیابی شد. یافته‌ها: با توجه به نتایج آنالیز محصولات PCR بر روی ژل الکتروفورز باند‌های مورد نظر برای ژن aafII، lt و st به ترتیب 384 ، 459 و 150 جفت باز به دست آمد. همچنین واکنش ژنوم باکتری‌های کنترل با پرایمر‌های طراحی‌شده، منفی بود. حد تشخیص براساس تعداد کپی برای ژن‌های st، lt و aafII به ترتیب برابر 390 ، 1500 و 2500 کپی به دست آمد. نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، طراحی این گونه تست‌ها در ایران به‌عنوان یک پیشرفت در زمینه بهبود تشخیص سریع و دقیق پاتوژن‌ها و تفکیک در نوع پاتوتایپ‌های اشرشیاکلی می‌باشد. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
اشرشیا کلی، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز، اسهال |
|
| عنوان انگلیسی |
Design and Optimization of PCR Assay for Rapid Detection of Enterotoxigenic and Enteroaggregative Pathotypes of E. coli |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background and Objectives: Escherichia coli is one of the most important causative agents of acute diarrheal disease in the world. Diarrheal diseases are one of the main causes of mortality among children in developing countries. The aim of this study was to develop a PCR technique for diagnosis of specific virulence genes of Enterotoxigenic E. coli (ETEC) and Enteroaggregative E. coli (EAEC). Methods: In this study, specific genes ST and LT were used for diagnosis of ETEC pathotype and AAF/II specific gene was used for diagnosis of EAEC pathotype. The PCR technique was designed and optimized for these three genes. The reaction products were cloned in pTZ57R/T vector as positive control. The primers’ sensitivity was determined by measurement of detection limit, and primers’ specificity was evaluated using other bacterial genomes. Results: According to the results of the PCR products analysis using agarose gel electrophoresis, the bands for AAF/II, LT, and ST were obtained 384, 459, and 150 bp, respectively. Also, the reaction of the genomes of control bacteria using the designed primers was negative. The detection limit based on copy number for ST, LT, and genes, was obtained 390, 1500, and 2500 copies, respectively. Conclusion: Considering the findings of this study, design of these assays in Iran is a progress in the improving rapid and accurate diagnosis of pathogens and detection of E. coli pathotypes. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
Escherichia coli, Polymerase chain reaction, Dysentery |
|
| نویسندگان مقاله |
محمد سلیمانی | mohammad soleimani
qom branch, islamic azad university
دانشگاه آزاد اسلامی، قم
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی قم (Islamic azad university of ghom)
عباس مروتی | abbas morovvati
qom branch, islamic azad university
دانشگاه آزاد اسلامی، قم
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی قم (Islamic azad university of ghom)
علی جوادی | ali javadi
tehran university of medical sciences
دانشگاه علوم پزشکی تهران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی تهران (Tehran university of medical sciences)
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-93-1&slc_lang=fa&sid=fa |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/70/article-70-313569.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
میکروب شناسی |
| نوع مقاله منتشر شده |
مقاله پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|