مجله دانشگاه علوم پزشکی قم، جلد ۹، شماره ۸، صفحات ۱۳-۲۰
عنوان فارسی طراحی مدل‌های پیش‌بینی، جهت تعیین ساختار ‌آنزیم استریول آسیل کریر پروتئین دیسچوراز ۱
چکیده فارسی مقاله زمینه و هدف: اسیدهای چرب ضروری مانند آلفا لینولئیک اسید به‌عنوان یک امگا-3 و آلفا لینولئیک اسید به‌عنوان یک امگا-6 در سلول‌های انسانی تولید نمی‌شوند. بنابراین، به‌وسیله منابع غذایی مانند ماهی، روغن سویا، دانه کتان و دانه‌های آفتابگردان تأمین می‌شوند. مراحل تولید آلفا لینولئیک اسید توسط 6 آنزیم صورت می‌گیرد که یکی از آنها آسیل کریر پروتئین دیسچوراز است. این مطالعه با هدف طراحی مدل‌های پیش‌بینی جهت تعیین ساختار ارگانیزمی ‌آنزیم استریول آسیل کریر پروتئین دیسچوراز 1 انجام شد. روش بررسی: تعدادی از ابزارهای بیوانفورماتیک جهت تعیین مهم‌ترین مشخصه‌های ژنی آنزیم آسیل کریر پروتئین دیسچوراز به جهت توسعه مدل‌های پیش‌بینی ارگانیزمی اجرا شد. سپس از تکنیک‌های داده‌کاوی مانند (Feature selection, Decision tree, Classification models) در جهت تولید الگوریتم‌های پیش‌بینی دقیق و کارآمد برپایه خصوصیات ژنی آنزیم (S-ACP-DES1) از ارگانیزم‌های مختلف استفاده شد. یافته‌ها: مهم‌ترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی‌ آنزیم (S-ACP-DES1)، فراوانی طول بوده است. همچنین مدل‌های پیش‌بینی طراحی‌شده نشان داد مدل Naive Bayse با معیار FCdb با دقت 38/97% می‌تواند ارگانیزم آنزیم‌های جدید را براساس خصوصیات ژنی پیش‌بینی کند. دو یافته فوق برای اولین بار در این مطالعه گزارش شدند. نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان داد با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی می‌توان به‌سهولت نسبت به دسته‌بندی آنزیم DESA1 براساس ارگانیزم آن اقدام کرد و متغیر طول ژن‌ها، بهترین شاخص برای این دسته‌بندی است. همچنین بهترین ماشین یادگیری مدل Baysian درNaive Bayse با دقت بالای 38/97% جهت تعیین آنزیم DESA1 برای اولین بار در این مطالعه گزارش شد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Designing Prediction Models to Determine the Structure of Stearoyl-Acyl Carrier Protein Desaturase 1
چکیده انگلیسی مقاله Background and Objectives: Essential fatty acids, such as α-linolenic acid (ALA), as an omega-3 fatty acid, and linoleic acid (LA), as an omega-6 fatty acid cannot be synthesized by human cells. Therefore, they should be provided from food sources, such as fish, soybean oil, flaxseed, and sunflower seeds. The process of α-linolenic acid synthesis is performed by 6 enzymes, one of which is stearoyl-acyl-carrier-protein-desaturase (S-ACP-DES). This study was carried out aiming at designing prediction models to determine the structure of stearoyl-acyl carrier protein desaturase 1. Methods:Some bioinformatics tools were used to determine the most important gene features of S-ACP-DES enzyme in order to develop some organism prediction models. Then, data mining techniques, such as feature selection, decision tree, and classification models, were used to develop efficient and accurate prediction algorithms based on gene features of enzyme (S-ACP-DES) from various organisms. Results: The most important gene feature in the identification of organism structures of the enzyme (S-ACP-DES) was frequency of length. Also, the designed prediction models indicated that Naive Bayes model with FCdb criteria and accuracy of 97.83% can predict new organism enzymes based on the gene features. The above findings have been reported for the first time in this study. Conclusion:The results of this study showed that with the use of bioinformatics tools, we can classify DESA1 enzyme based on its organism, and the variable of the length of genes is the best indicator for this classification. Also, the best learning machine model in Naive Bayes was Bayesian with high accuracy of 38.97% for determination of DESA1 enzyme, which has been reported for the first time in this study.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله علی سالاری | ali salari
islamic azad university, borujerd
دانشگاه علوم پزشکی قم
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی قم (Qom university of medical sciences)

سیدمرتضی رضوی | seyed morteza razavi
university of al-khwarizmi
دانشگاه خوارزمی
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه خوارزمی (Kharazami university)

منصور ابراهیمی | mansour ebrahimi
university of qom
دانشگاه قم
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه قم (Qom university)

نشانی اینترنتی http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-21&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده داخلی
نوع مقاله منتشر شده مقاله پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات