|
|
مجله دانشگاه علوم پزشکی قم، جلد ۱۱، شماره ۳، صفحات ۱۱-۲۱
|
|
|
| عنوان فارسی |
مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با DNA استخراجشده توسکیت برای ردیابی ژنهایOPrL ،ExoA ، algDدر ایزولههای بالینی سودوموناس آئروژینوزا |
|
| چکیده فارسی مقاله |
زمینه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا، یکی از رایجترین عوامل عفونتهای بیمارستانی محسوب میشود. بیشتر آزمایشگاهها بهطور معمول برای شناسایی سودوموناس آئروژینوزا، از روش کشت و تستهای بیوشیمیایی مختلف استفاده میکنند که روشی وقتگیر بوده و در برخی موارد دارای نتایج مثبت و منفی کاذب میباشد. هدف از انجام این پژوهش مقایسه دو روش مولکولی PCR با استفاده از DNA استخراجشده با کیت و PCR با استفاده از کلنی مستقیم در تشخیص ایزولههای سودوموناس آئروژینوزا بود. روش بررسی: در این مطالعه توصیفی – تحلیلی، از 395 ایزوله بالینی مختلف، 85 ایزوله با تستهای بیوشیمیایی اولیه و کشت بر روی محیطهای اختصاصی سودوموناس آئروژینوزا تشخیص داده شدند. سپس با استفاده از ژنهای OPrL،ExoA ، algD با دو روش مولکولی PCR مستقیم و PCR با استفاده از DNA استخراجشده با کیت، مورد ارزیابی قرار گرفتند. یافتهها: از مجموع 85 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا که به روش فنوتیپی، غربالگری شده بودند، 81 ایزوله به روش PCR با استفاده از DNA استخراجشده با کیت، حاوی ژنهای OPrL، ExoA، algD (با طول نوکلئوتیدهای 504، 396 و 526 جفت باز) و80 ایزوله نیز به روش PCR مستقیم، دارای ژنهای مذکور بودند. نتیجهگیری: نتایج این تحقیق نشان داد بدون استفاده از کیتهای استخراج میتوان به نتایج تشخیصی قابلقبول در شناسایی سودوموناس آئروزینوزا دست یافت. از طرفی، در نتایج بهدستآمده میتوان خطای روشهای تشخیصی فنوتیپی سودوموناس آئروژینوزا را مشاهده کرد. |
|
| کلیدواژههای فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
Comparison of Two Methods of Direct PCR and PCR with DNA extracted by Kit for Detection of OPrL, ExoA, and algD genes in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background and Objectives: Pseudomonas aeruginosa is one of the most common causes of nosocomial infections. Most laboratories usually use culture method and various biochemical tests for identification of P. aeruginosa, which are time-consuming and sometimes lead to false positive and negative results. The aim of this study was to compare two methods of PCR with DNA extracted by kit and PCR with direct colony for detection of P. aeruginosa isolates. Methods: In this descriptive-analytical study, out of 395 different clinical isolates, 85 isolates were identified using basic biochemical tests and culture on P. aeruginosa specific media. Then, they were assessed by OPrL, ExoA, algD genes using two methods of direct PCR by using DNA extraction kit and direct PCR and PCR with DNA extracted by kit. Results: Out of 85 P. aeruginosa isolates detected by phenotypic screening, 81 isolates had OPrL, ExoA, algD genes using PCR with DNA extracted by kit with (amlicon size, 504, 396, and 526 bp) and 80 isolates had the mentioned genes using direct PCR. Conclusion: This study showed that, acceptable diagnostic results can be achieved in the identification of P. aeruginosa without using extraction kits three stable gens of P. aeruginosa detect by using two different molecular methods. The results showed that, without using extraction kit can be acceptable diagnostic obtained of Pseudomonas aeruginosa. On the other hand, in the obtained results, phenotypic P. aeruginosa detection methods’ error can be observed. |
|
| کلیدواژههای انگلیسی مقاله |
Pseudomonas aeruginosa, PCR, ExoA gene, DNA |
|
| نویسندگان مقاله |
حامد طهماسبی | hamed tahmasebi department of microbiology, school of medicine, zahedan university of medical science گروه میکروب شناسی زاهدان- دانشکده پزشکی
جواد ادبی | javad adabi department of microbiology, school of medicine, zahedan university of medical science, zahedan,iran گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان، زاهدان، ایران سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی زاهدان (Zahedan university of medical sciences)
شهرام شهرکی زاهدانی | shahram shahraki zahedani infectious diseases amp;amp; tropical medicine research center, zahedan university of medical sciences, zahedan, iran. گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان، زاهدان، ایران سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی زاهدان (Zahedan university of medical sciences)
بهروز زینی | behroz zeyni department of microbiology, faculty of medicine, hamadan university of medical sciences, hamadan, iran. دانشگاه علوم پزشکی زاهدان سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی زاهدان (Zahedan university of medical sciences)
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-146-4&slc_lang=fa&sid=fa |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/70/article-70-407703.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
میکروب شناسی |
| نوع مقاله منتشر شده |
مقاله پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|