مجله دانشگاه علوم پزشکی قم، جلد ۱۱، شماره ۷، صفحات ۹۸-۱۱۶
عنوان فارسی یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری
چکیده فارسی مقاله زمینه و هدف: سرطان پروستات ازجمله سرطان‌های شایع میان مردان است که ناهمگونی بسیار بالایی را در ویژگی‌های ژنتیکی و پاتولوژیکی از خود نشان می‌دهد. توضیح روابط تنظیمی بین mRNA و microRNA می‌تواند به شناسایی الگوی تنظیم بیان ژن در سرطان پروستات بدخیم کمک کند. در این مطالعه یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری بررسی گردید. روش بررسی: در مطالعه حاضر از داده‌های بیانی (ژن و microRNA) بیماران مبتلا به سرطان پروستات، به‌منظور بررسی شبکه اندرکنش ژنی تومور بدخیم پروستات استفاده شد. شبکه هم‌بیان ژنی وزن‌دار برای گروه‌بندی ژن‌ها و یافتن گروه‌های ژنی که همبستگی قابل‌توجهی با متغیر زمان عود بیوشیمیایی بیماری دارند، به کار برده شد. هدف‌های ژنی microRNA‌های با تفاوت بیان از پایگاه‌های داده مبتنی بر پیشگویی و شواهد آزمایشگاهی گردآوری شد. با تلفیق آن با نتایج همبستگی پیرسون داده‌های بیانی ژن و microRNA، شبکه تنظیمی microRNA به دست آمد. یافته‌ها: دوگروه ژنی با همبستگی بالا با زمان عود بیوشیمیایی شناسایی شدند. یکی از این دو در مسیرهای تنظیم و تقسیم چرخه سلولی درگیر شده که جزء مسیرهای مشخصه سرطان است. تلفیق شبکه هم‌بیان با شبکه تنظیمی microRNA نشان داد اولاً این microRNA‌ها، مسیرهایی را هدف قرار می‌دهند که در بدخیم شدن تومور پروستات نقش دارند و دوماً چندین عنصر کلیدی شامل microRNA و ژن را معرفی می‌کنند. نتیجه‌گیری: در مطالعه حاضر، جزئیات بیشتری از اجزای عملکردی کلیدی که باعث بدخیم‌شدن تومور پروستات می‌شوند به دست آمد. این جزئیات ممکن است فرصت‌های جدیدی را برای توسعه روش‌های جایگزین درمانی فراهم کند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله سرطان پروستات، بیان ژن، microRNA، شبکه‌های تنظیم ژن
عنوان انگلیسی Co-Expression and Microrna Regulatory Network Integration in Metastatic Prostate Tumor Using Microarray Expression Data Analysis
چکیده انگلیسی مقاله Background and objectives: Prostate cancer is one of the most prevalent cancer in men which shows high heterogeneity in genetic and pathological features. Elucidating the regulatory relationships between microRNAs and mRNAs can help to identification of gene regulatory patterns in metastatic prostate cancer.   Methods: In the present study prostate cancer patient's expression data (gene and microRNA) was used to study gene interactions in metastatic prostate tumor. Weighted gene co-expression network have been implemented for gene clustering and finding gene modules correlation with biochemical recurrence free survival variable. Differentially expressed microRNA gene targets were obtained from experimentally validated and prediction based databases and alongside with gene and microRNA expression, Pearson correlations measurements were implemented to constructing microRNA regulatory network.   Results: Two significant modules were detected in co-expressed modules significant analysis for biochemical recurrence free variable. One of them involved in cell cycle regulation and cell proliferation pathways which are hallmark pathways of progressed cancers. Integration of gene co-expression network with microRNA regulation network shows, first: Micrornas target pathways which involved in the progression of prostate cancer to metastatic stage, and second: introduce several key factors including microRNA and genes.   Conclusion: Present study revealed more details on key functional components in prostate cancer development. These details may provide opportunities for the development of alternative therapeutic approaches.  
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله مهدی صادقی | mehdi sadeghi
department of biophysics, faculty of biological sciences, tarbiat modares university, tehran, iran
گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)

مجمدرضا گنجعلی خانی | mohammad reza ganjalikhani
department of biology, faculty of sciences, university of isfahan, isfahan, iran
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه اصفهان (Isfahan university)

بیژن رنجبر | bijan ranjbar
department of biophysics, faculty of biological sciences, tarbiat modares university, tehran, iran
گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)

نشانی اینترنتی http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-141-1&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/70/article-70-448076.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده اورولوژی
نوع مقاله منتشر شده مقاله پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات