|
|
، جلد ۲۱، شماره ۷، صفحات ۶۸-۷۹
|
|
|
| عنوان فارسی |
رویکردی جدید جهت شناسایی و تعیین ارتباط جهش‌های ژنی mecA بر مبنای HRM با نوع نمونه بالینی در ایزوله‌های استافیلوکوک اورئوس |
|
| چکیده فارسی مقاله |
زمینه و هدف: جهش ژنی در استافیلوکوک اورئوس از مهم‌ترین دلایل ایجاد سویه‌های مقاوم به آنتی‌بیوتیک است. روش آنالیز منحنی ذوب DNA با قدرت تفکیک بالا(HRM) می‌تواند این جهش‌ها را با کیفیت بسیار بالایی شناسایی کند. هدف از این مطالعه، ارزیابی نقش نوع نمونه بالینی در بروز جهش‌های نوکلئوتیدی در ژن mecA استافیلوکوک اورئوس به روش HRM بود. مواد و روش‌ها: در این مطالعه تجربی، از 43 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس استفاده شد. جهت شناسایی جهش‌های احتمالی، ایزوله‌های دارای ژن mecA شناسایی و ژن مربوطه تعیین توالی شد. سپس، تجزیه و تحلیل داده‌ها با استفاده از نرم‌افزارهای StepOne v2.3 وHRM v3.0.1 انجام شد. نتایج تعیین توالی به عنوان استاندارد طلایی مورد استفاده قرار گرفت. ملاحظات اخلاقی: این مطالعه با کد اخلاق IR.UMSHA.REC.1396.637 در کمیته اخلاق پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی همدان به تصویب رسیده است. یافته‌ها: از 43 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس، 11 ایزوله (58/25 درصد) دارای ژن mecA و 32 ایزوله (41/47 درصد) فاقد ژن mecA بودند. با توجه به نمونه‌های بالینی مختلف، 3 ایزوله (27/27 درصد) مقاوم به متی‌سیلین از نمونه خون، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه ادرار، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه زخم، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه کاتاتر، 1 ایزوله (09/9 درصد) از آبسه و 1 ایزوله (09/9 درصد) هم از سواپ بینی جدا شد. در این بین، ایزوله‌های گرفته شده از زخم و ادرار دارای بیشترین جهش در اسید‌آمینه آدنین به‌صورت A→T، A→G، A→C و A→X مشاهده شد. ایزوله‌های جدا شده از خون داری جهش در اسید آمینه گوانین به‌صورت G→A بودند. نتیجه‌گیری: ارتباط معنی‌داری بین نوع جهش و نوع نمونه بالینی در ایزوله‌های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین دیده شد. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین، جهش ژنی، منحنی ذوب DNA ،HRM |
|
| عنوان انگلیسی |
A New Approach to Identify and Determine the Relationship between MecA Gene Mutations Based on HRM with Clinical Species in Staphylococcus aureus Isolates |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background and Aim: Gene mutation in Staphylococcus aureus is one of the most important causes of antibiotic-resistant strains. The High Resolution Melting Curve (HRM) analysis of DNA method can detect these mutations very high quality. The purpose of this study was to evaluate the role of clinical sample type in the occurrence of nucleotide mutations in the mecA gene of S. aureus by HRM method. Materials and Methods: In this experimental study, 43 clinical isolates of S. aureus were used. To detect possible mutations, isolates with mecA gene were replicated and sequenced. Then, analysis was performed using StepOne Software v2.3 and HRM v3.0.1 software. Sequencing results were used as gold-standard. Ethical Considerations: This study with research ethics code IR.UMSHA.REC.1396.637 has been approved by research ethics committee at Hamadan University of Medical Sciences. Findings: Of 43 clinical isolates of S. aureus, 11 isolates (25.58%) had mecA gene and 32 isolates (47.41%) lacked the mecA gene. According to different clinical samples, 3 isolates (27.27%) were resistant to methicillin from blood samples, 2 isolates (18.18%) from urine specimens, 2 isolates (18.18%) from wound samples, 2 isolates (18.18%) of the catheter samples, 1 isolate (9.09%) of the abscess and 1 isolate (9.09%) were separated from the nose swab. In the meanwhile, isolates from the wound and urine had the highest mutation in the adenine amino acid as A → T, A → G, A → C, and A → X. Isolates taken from blood have mutations in Guanine amino acid as G → A. Conclusion: There was a significant relationship between type of mutation and type of clinical specimen in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
حامد طهماسبی | Hamed Tahmasebi
Department of Microbiology, School of Medicine, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran.
گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان، زاهدان، ایران.
ساناز ده باشی | Sanaz Dehbashi
Department of Microbiology, School of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran.
گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران.
محمد رضا عربستانی | Mohammad Reza Arabestani
Department of Microbiology, School of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran. Nutrition Health Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran.
گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران. مرکز سلامت تغذیه، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران.
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2844-7&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/2736/article-2736-2048382.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
علوم پایه |
| نوع مقاله منتشر شده |
پژوهشی اصیل |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|