|
|
، جلد ۱۸، شماره ۳، صفحات ۶۷-۷۹
|
|
|
| عنوان فارسی |
بررسی داکینگ مولکولی آنزیم پروتئاز ویروس HIV-۱ با ترکیبات تری ترپنوئیدی با منشأ گیاهی و قارچی |
|
| چکیده فارسی مقاله |
زمینه و هدف: به دلیل توان بالای عفونتزایی و مقاومتهای دارویی گزارش شده در ویروس HIV-1 طی سالهای اخیر، پژوهشهای زیادی در خصوص کشف و معرفی داروهای ضد ویروس HIV-1 انجام شده است. نتایج بررسیهای متعدد نشان داده است که داروها و ترکیبات مهارکننده پروتئاز که سهم عمدهای از آنها را مشتقات گیاهی به ویژه ترپنوئیدها تشکیل میدهند، در کنترل عفونت ناشی از ویروس HIV-1 بسیار موثر میباشند. هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار آنزیم پروتئاز HIV-1 به وسیلهی داروهای استاندارد و ترکیبات تری ترپنوئیدی با منشا گیاهی و قارچی میباشد. مواد و روشها: این پژوهش به روش توصیفی –تحلیلی انجام گرفت. برای انجام این بررسی بیوانفورماتیکی، ساختار مربوط به داروها، ترکیبات تری ترپنی و آنزیم پروتئاز HIV-1 به ترتیب از پایگاه دادههای Chem spider، Pubchem، HMDB و PDB دریافت شد. سپس داکینگ مولکولی به وسیله نرم افزار iGEMDOK2.1 انجام گرفت. یافتهها: نتایج نشان داد که محل برهمکنش ترکیبات تری ترپنی همانند داروهای استاندارد، سه ناحیه حفاظت شده و کاتالیتیکی دومین مرکزی، فلاپ و دومین انتهای کربوکسیل خصوصا اسید آمینههای Asp25-Gly27-Ala28-ASP29-Asp30 واقع در جایگاه فعال پروتئاز HIV-1 میباشد. همچنین بررسی برهمکنشهای این نواحی نشان داد که استحکام میانکنشهای ایجاد شده در این مناطق ارتباط مستقیمی با مقادیر IC50 این ترکیبات دارد. نتیجهگیری: در پایان با توجه به اثر بخشی بالا و عمل اختصاصی تری ترپنوئیدها میتوان نتیجه گرفت که این ترکیبات میتوانند به عنوان داروهای موثرضد پروتئاز HIV-1 مطرح شوند. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
ببیوانفورماتیک، ترپنوئید، داکینگ، ویروس HIV-1 |
|
| عنوان انگلیسی |
Molecular Docking Study of HIV-1 Protease with Triterpenoides Compounds from Plants and Mushroom |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background: Because of the reported high ability of virulence and medicinal resistance of HIV-1 virus during the last decades, many investigations have been performed concerning discovery and the introduction of anti-HIV-1 drugs. The results of numerous researches have shown that drugs and protease inhibitory compounds mainly containing plant derivatives specially terpenoids may control HIV-1 infection very effectively. The aim of this research is the bioinformatical study of HIV-1 protease inhibition by standard drugs and triterpenoides from plant and mushroom. Materials and Methods: This is a descriptive-analytic study. In the present study , the structure of drugs, triterpene comounds, and HIV-1 protease enzyme was received from the databases such as Chem Spider, PubChem, Human Metabolome Database (HMDB), and Protein Data Bank (PDB). After that, molecular docking was performed by iGRMDOCK 2.1 software Results: The results confirmed that the interactions of the triterpene compounds like the standard drugs were in three safeguarded and catalytic areas including central domain, flap and carboxylic terminal domain specially amino acids Asp25, Asp27, Ala28, Asp29 and Asp30 in active sites of HIV-1 protease. Also, The study of the interactions of these areas showed that there is a direct correlation between the strength of the interactions and IC50 values of these compounds. Conclusion: Finally, with due attention to the high effectiveness and the proprietary function of triterpenoids, we can conclude that these compounds may be considered as effectire HIV-1 antiprotease drugs. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
Bioinformatic, Triterpenoid, Docking, HIV-1 virus |
|
| نویسندگان مقاله |
مختار نصرتی | Mokhtar Nosrati
University of Isfahan, Isfahan, Iran
دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
ماندانا بهبهانی | Mandana Behbahani
Department of Microbial Biotechnology, University of Isfahan, Isfahan, Iran
گروه بیوتکنولوژی میکروبی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3278-4&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/2736/article-2736-2048789.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
علوم پایه |
| نوع مقاله منتشر شده |
پژوهشی اصیل |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|