|
|
، جلد ۱۵، شماره ۴، صفحات ۱۸-۲۵
|
|
|
| عنوان فارسی |
تشخیص سریع RNA ویروس HIV-۱ به وسیله روش Real-time Transcription mediated amplification |
|
| چکیده فارسی مقاله |
زمینه و هدف: روش‌های ملکولی متعددی توسعه یافته‌اند که قادرند با حساسیت و ویژگی متفاوتی HIV-1 را در نمونه‌های بالینی تشخیص دهند. در این مقاله نتایج حاصل از یک مطالعۀ ارتباط سنجی در راه اندازی و به کارگیری یک روش Real-time PCR TMA نوین جهت تشخیص هم دمای ویروس HIV-1 ارائه شده است. مواد و روش‌ها: در این مطالعۀ مقطعی، ست پرایمر و پروب Molecular Beacon توسط نرم افزارهای اختصاصی و برای یک ناحیۀ 176 جفت بازی از ژن pol ویروس HIV-1 طراحی شد. برای تعیین حساسیت آنالیتیک واکنش از رقت‌های لگاریتمی 10-107 کپی RNAهای حاصل از رونویسی در آزمایشگاه، به عنوان استاندارد استفاده شد. برای ارزیابی حساسیت و ویژگی کلینیکی واکنش از نمونه‌های بالینی استفاده شد که پیش از این مثبت و منفی بودن آنها به وسیلۀ یک تست تجاری معتبر تایید شده بود. یافته‌ها: حساسیت آنالیتیک و کلینیکی این روش به ترتیب معدل 500 کپی در میلی‌لیتر و 3/93 درصد در نظر گرفته شد. پرایمرها و پروب طراحی شده تنها به توالی‌های اختصاصی HIV-1 متصل می‌گردند و مطالعات بیوانفورمانیکی هیچ گونه واکنش متقاطعی با ژنوم سایر ویروس‌های انتقال یابنده از طریق خون و ژنوم انسان نشان ندادند. ویژگی کلینیکی روش نیز به طور تجربی و با بررسی 20 نمونۀ منفی به وسیلۀ روش Real-time TMA راه اندازی شده، مورد آزمایش قرار گرفت و معادل 100 درصد در نظر گرفته شد. نتیجه‌گیری: روشTMA Real-time راه‌اندازی شده به علت دارا بودن سرعت، حساسیت و سادگی می‌تواند به عنوان ابزار مفیدی جهت تشخیص سریع و هم دمای ویروس HIV-1 در نمونه‌های خون و پلاسمای بیماران استفاده شود. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
Rapid detection of HIV-1 viral RNA by real-time transcription mediated amplification assay |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background: Several different molecular methods have been developed that are capable of detecting HIV-1 in clinical specimens with different levels of sensitivity and specificity. This article describes the results of a reliability study on the development and application of a new real-time TMA method for isothermal detection of HIV-1. Materials and Methods: In this ex Primental study, the molecular beacon primer and probe set were designed for a 176-base-pair region of HIV-1 pol gene using a specialized software. Logarithmic serial dilutions from 10-107 copies of an in-vitro transcribed RNA were used for determination of the analytical sensitivity of the assay. Clinical specimens that had previously been evaluated positive or negative by a valid commercial assay were used for assessing the clinical sensitivity and specificity of the assay. Results: The analytical and clinical sensitivities of the assay were determined 500 copies/ml and 93.3%, respectively. The primers and the probe were HIV-1 specific and no cross-reaction was observed with other blood-borne viruses and human genome bioinformatically. The clinical specificity of the developed real-time TMA assay was examined experimentally using 20 negative samples and determined to be 100%. Conclusion: The developed real-time TMA assay can be used as an appropriate tool for the rapid and isothermal detection of HIV-1 in patients' blood and plasma samples. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
مهدی پریان | Mahdi Paryan
pasteur institute
انستیتوپاستور ایران
سمیرا محمدی یگانه | Samira Mohammadi yeganeh
pasteur institute
انستیتوپاستور ایران
بهزاد خوانساری نژاد | Behzad Khansari nejad
tarbiat modares university
تربیت مدرس
مهدیه موندنی زاده | Mahdieh Mondanizadeh
medical university of hamedan
دانشگاه علوم پزشکی همدان
سعید پریان | Saeed Paryan
medical university of mashhad
دانشگاه علوم پزشکی مشهد
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1016-2&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/2736/article-2736-2049126.pdf |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
عمومی |
| نوع مقاله منتشر شده |
پژوهشی اصیل |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|