، جلد ۲۲، شماره ۵، صفحات ۳۲-۴۳
عنوان فارسی پیش‌بینی بیوانفورماتیکی miRNA‌های هدف گیرنده ژن‌های BAFF و APRIL در بیماران مبتلا به لوسمی لنفوسیتی مزمن
چکیده فارسی مقاله زمینه و هدف لوسمی لنفوسیتی مزمن شایع‌ترین لوسمی در بزرگسالان است که حدود 25 تا 30 درصد از کل لوسمی‌ها را شامل می‌شود. از علل مهم اتیولوژیک این لوسمی می‌توان به اختلال در مسیر پیام‌رسانی NF-kB اشاره کرد. دو پروتئین APRIL و BAFF با تأثیر در مسیر پیام‌رسانی NF-kB در بیماری‌زایی این لوسمی ایفای نقش می‌کنند. بنابراین در مطالعه پیش رو با توجه به اثر تنظیمی miRNA‌ها در بسیاری از فرایندهای سلولی، به پیش‌گویی miRNA‌های شاخص هدف گیرنده ترانسکریپت‌های مربوط به APRIL و BAFF با استفاده از نرم‌افزار‌های بیوانفورماتیکی مختلف و اختصاصی پرداخته شد. مواد و روش ها بعد از دریافت توالی پروتئین‌های APRIL و BAFF از سایت NCBI، با کمک پایگاه‌های بیوانفورماتیکی miRanda، TargetScan، miRWalk، DIANA و miRDB با الگوریتم‌های متفاوت به بررسی و پیش‌گویی miRNA‌های هدف گیرنده ژن‌های مذکور پرداخته شد. ملاحظات اخلاقی این مطالعه در کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی اراک تصویب شده است. یافته ها درنهایت بر اساس امتیازدهی توسط نرم‌افزارهای بیوانفورماتیک مذکور و بالاتربودن امتیاز و هدف‌گیری مناسب‌تر، has-miR-145-5p و has-miR-185-5p به عنوان miRNA‌های هدف گیرنده ژن APRIL و همچنین has-miR-424 و has-miR-497 به عنوان miRNA‌های هدف گیرنده ژن BAFF معرفی و برای فاز مطالعات عملی آینده انتخاب شدند. نتیجه گیری با توجه به نقش مهم ژن‌های APRIL و BAFF در روند طبیعی مرگ سلولی و تکامل سلول‌های B به نظر می‌رسد می‌توان از این mi-RNA‌های پیش‌گویی‌شده با کمک پایگاه‌های بیوانفورماتیک با الگوریتم متفاوت به عنوان بیومارکرهای مولکولی تشخیصی در جهت شناسایی بیماران مبتلا به لوسمی لنفوسیتی مزمن سود جست.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Bioinformatic Prediction of miRNAs Targeting APRIL and BAFF Genes in Chronic Lymphocytic Leukemia
چکیده انگلیسی مقاله Background and Aim Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) is the most commonly occurring leukemia in adults, accounting for about 30-25% of total leukemia. One of the important etiological causes of this leukemia is the disruption of the Nuclear Factor Kappa B (NF-kB) signaling pathway. The two proteins of Apoptosis-Inducing Ligand (APRIL) and B-Cell Activating Factor (BAFF) play a role in the pathogenesis of this leukemia by affecting the NF-kB signaling pathway. In this study, due to the effect of miRNAs in regulating many cellular processes, the prediction of the prominent miRNAs targeting APRIL and BAFF transcripts in B-cell CLL patients was evaluated using specific and different bioinformatics programs. Methods & Materials Afterwards retrieving the sequences of APRIL and BAFF proteins from the NCBI website, by using several programs including miRanda, TargetScan, miRWalk, DIANA and miRDB with different algorithms, the prediction of miRNAs targeting these genes was investigated. Ethical Considerations This study was approved by the Research Ethics Committee of Arak University of Medical Sciences. Results Based on the scoring system of bioinformatics programs, "hsa-miR-145-5p" and "hsa-miR-185-5p" were identified as miRNAs targeting APRIL gene, while "hsa-miR-424" and "hsa-miR-497"were miRNAs targeting BAFF gene. They were suggested for the practical studies in future. Conclusion Based on the important role of APRIL and BAFF genes in the normal process of cell death and B-cell evolution, it seems that the mi-RNAs predicted by bioinformatics programs using different algorithms can be used as a diagnostic molecular biomarker to identify B-cell CLL patients.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله مهدیه موندنی زاده | Mahdieh Mondanizadeh
Molecular and Medical Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.; Department of Biotechnology and Molecular Medicine, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
دانشگاه علوم پزشکی اراک-

نیلوفر مرادی | Niloofar Moradi
Department of Biotechnology and Molecular Medicine, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
دانشگاه علوم پزشکی اراک-

راضیه امینی | Razieh Amini
Department of Biotechnology and Molecular Medicine, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
دانشگاه علوم پزشکی اراک-

بهزاد خوانساری نژاد | Behzad Khansarinejad
Molecular and Medical Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.; Department of Microbiology and Immunology, School of Paramedicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
دانشگاه علوم پزشکی اراک-

قاسم مسیبی | Ghasem Mosayebi
Molecular and Medical Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.; Department of Microbiology and Immunology, School of Paramedicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
دانشگاه علوم پزشکی اراک-

نشانی اینترنتی http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-53-15&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/2736/article-2736-2260272.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده علوم پایه
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی اصیل
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات