|
Iranian Journal of Veterinary Medicine، جلد ۱۴، شماره ۳، صفحات ۲۷۳-۲۸۷
|
|
|
عنوان فارسی |
انتخاب ژن رفرنس در بافت های چربی و ماهیچه بره های دنبه دار لری بختیاری |
|
چکیده فارسی مقاله |
زمینه مطالعه: گوسفندان دنبه دار توانایی منحصر به فردی برای تحمل دورههای با تعادل منفی انرژی دارند. این توانایی به وجود بافت چربی دنبه به عنوان یک ذخیره انرژی بدنی ربط داده شد هرچند مکانیسمهای کنترل کننده پاسخ بافتهای چربی به نوسانات تعادل انرژی به خوبی مشخص نشده است. هدف: با توجه به این امر که مشخص کردن ژن رفرنس پایدار یک پیش نیاز برای هرگونه مطالعه بیان ژنی است، مطالعه حاضر بر آن شد تا ژنهای رفرنس با بیشترین میزان پایداری در بافتهای چربی و ماهیچه بره های دنبهدار لری بختیاری در طول دورههای با تعادل منفی و مثبت انرژی را مشخص کند. روش کار: در این آزمایش 18 بره دنبه دار نر لری-بختیاری بر اساس وزن بدن به سه گروه تقسیم شدند. آزمایش شامل دورههای عادتپذیری، تعادل منفی و مثبت انرژی به ترتیب در 2، 3 و 3 هفته بود. 3 گروه از بره ها به ترتیب در انتهای دوره عادت پذیری، انتهای دوره با تعادل منفی انرژی و انتهای دوره با تعادل مثبت انرژی کشتار شدند و نمونههای بافت مختلف چربی و ماهیچه گرفته شد. نتایج: پایداری ژنهای رفرنس در بین بافت های مختلف و همچنین بین مکانهای مختلف بافت چربی متفاوت بود. میانگین رتبهبندی توسط نرم افزارهای مختلف نشان داد که glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)، B-actin و(peptidylprolyl isomerase A (PPIA جزء سه ژن با بیشترین پایداری در بافت چربی چادرینهای بودند در حالی که در بافت چربی دنبه ژنهای PPIA، Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide (YWHAZ)I و(RNA polymerase II subunit A (POLR2A جزء ژنهای با کمترین نوسان در بیان در طی دورههای با تعادل منفی و مثبت انرژی بودند. ژنهای B-actin، YWHAZ و phosphoglycerate kinase 1ا(PGK1) جزء ژنهای با بیشترین ثبات در بیان در بافت عضله چشمی برههای لری بختیاری در تعادلهای مختلف انرژی بودند. نتیجه گیری نهایی: نتایج مطالعه حاضر نشان داد که ثبات بیان ژنهای رفرنس در بین بافتهای چربی چادرینه و دنبه متفاوت است و سطح تعادل انرژی باعث اثر بر میزان بیان آنها میگردد. به علاوه، رتبهبندی ژنهای رفرنس توسط نرمافزارهای مختلف متفاوت میباشد که این امر میتواند به دلیل الگوریتمهای ریاضی متفاوت بکار گرفته شده توسط نرمافزارهای مختلف باشد. |
|
کلیدواژههای فارسی مقاله |
|
|
عنوان انگلیسی |
Reference Gene Selection in Adipose and Muscle Tissues of Fat-tailed Lori-Bakhtiari Lambs |
|
چکیده انگلیسی مقاله |
BACKGROUND: Fat-tailed sheep breeds have a unique ability to tolerate periods of negative energy balance due to seasonal changes in feed availability. This ability is attributed to presence of fat-tail as a body energy reserve, however the exact underlying mechanisms controlling the response of adipose tissue depots to variations in energy balance in fat-tailed breeds are not well understood. OBJECTIVES: As definition of a set of stable reference gene is an absolute prerequisite of any gene expression study, therefore the current research was conducted to define the most stable reference genes in adipose tissue depots and muscle of fat-tailed Lori-Bakhtiari lambs during periods of negative and positive energy balances. METHODS: Eighteen fat-tailed Lori-Bakhtiari male lambs were divided into 3 groups according to their body- weight. The experiment was consisted of an adaptation period (2 weeks), negative energy balance period (3 weeks), followed by positive energy balance period (3 weeks). The 3 groups of lambs were randomly selected and slaughtered at the beginning and end of negative energy balance and at the end of positive energy balance to collect samples of muscle and adipose tissue depots. RESULTS: The stability of the reference genes differed among different tissues and also between various depots of adipose tissue. Average of ranking by different software programs showed that glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), B-actin and peptidylprolyl isomerase A (PPIA) were the 3 most stable reference genes in mesenteric adipose tissue, whereas in fat-tail adipose tissue, PPIA, tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide (YWHAZ) and RNA polymerase II subunit A (POLR2A) were considered as genes with least expression variability during periods of negative and positive energy balance. B-actin, YWHAZ and phosphoglycerate kinase 1 (PGK1) were defined as the most stable reference genes in longissimus dorsi muscle tissue of Lori-Bakhtiari lambs. CONCLUSIONS: The results of the current study demonstrate that the stability of the reference genes varied between mesenteric and fat-tail adipose tissues and the level of energy balance affects the stability of the refer- ence genes. In addition, ranking of the reference genes differs among different software programs possibly due to different mathematical algorithms used by different programs. |
|
کلیدواژههای انگلیسی مقاله |
adipose tissue, Energy balance, Fat-tailed Sheep, Longissimus dorsi muscle, Reference gene |
|
نویسندگان مقاله |
Alireza Aziziyan | Department of Animal Sciences, College of Agriculture and Natural Rsources, University of Tehran, Karaj, Iran
Mostafa Sadeghi | Department of Animal Sciences, College of Agriculture and Natural Rsources, University of Tehran, Karaj, Iran
Mahdi Ganjkhanlou | Department of Animal Sciences, College of Agriculture and Natural Rsources, University of Tehran, Karaj, Iran
Hossein Zakariapour Bahnamiri | Department of Animal Sciences, College of Agriculture and Natural Rsources, University of Tehran, Karaj, Iran
|
|
نشانی اینترنتی |
https://ijvm.ut.ac.ir/article_78334_0c518a74900c1c99715cb7ad090f902f.pdf |
فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
کد مقاله (doi) |
|
زبان مقاله منتشر شده |
en |
موضوعات مقاله منتشر شده |
|
نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|