|
|
، جلد ۲۳، شماره ۳، صفحات ۳۷۴-۳۸۵
|
|
|
| عنوان فارسی |
پیش‌بینی بیوانفورماتیک miRNAهای هدف‌گیرنده ژن‌های E۶ و E۷ ویروس پاپیلومای انسانی تیپ ۱۶ و ۱۸ در سرطان دهانه رحم |
|
| چکیده فارسی مقاله |
زمینه و هدف: سرطان دهانه رحم (CC) سومین بدخیمی شایع در خانم‌هاست که عمده‌ترین علت ایجاد آن، ویروس پاپیلومای انسانی (HPV) است. دو انکوژن E6 و E7 این ویروس در روند تومورزایی آن نقش مهمی ایفا می‌کنند. امروزه، روش‌های موجود برای غربالگری CC توانایی تشخیص بیماری را در مراحل اولیه ندارند؛ بنابراین، شناسایی بیومارکر‌های جدید جهت تشخیص به‌موقع این سرطان حائز اهمیت است. بدین منظور، در مطالعه حاضر، miRNAهای هدف‌گیرنده دو انکوژن E6 و E7 ویروس پاپیلومای انسانی (تیپ 16 و 18) در CC با روش‌های بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفتند. مواد و روش ها: ابتدا با استفاده از پایگاه NCBI توالی ژن‌های E6 و E7 برای هر دو تیپ 16 و 18 ویروس پاپیلومای انسانی به دست آمد. سپس با استفاده از پایگاه‌های بیوانفورماتیکی miRBase و RNA22 مناسب ترین miRNAهای هدف‌گیرنده ژن‌های مذکور انتخاب شدند. ملاحظات اخلاقی: این مطالعه در کمیته اخلاق دانشگاه علوم‌پزشکی اراک تصویب شد. یافته ها: با توجه به میزان p-value به‌دست‌آمده از پایگاه‌های بیوانفورماتیکی، miRNAهای (p-value=7/51e-2) miR-92a-5p miR-195-3p (p-value=2.24e-1) ،miR-34a-5p (p-value=2.73e-1) و miR-155-5p (p-value=4.95e-2) برای دو ژن E6 و E7 معرفی شدند. نتیجه گیری: نتایج حاصل از بررسی‌های بیوانفورماتیکی نشان داد از بین چهار miRNA شناسایی‌شده، احتمالاً miR-155-5p و miR-92a-5p به ترتیب به عنوان miRNAهای هدف‌گیرنده اختصاصی ژن‌های E6 و E7 هستند؛ بنابراین، به نظر می‌رسد این miRNAها می‌توانند کاندید مناسبی برای مطالعات آزمایشگاهی در بیماران مبتلا به CC باشند. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
پایگاه‌های بیوانفورماتیک، miRNA، سرطان دهاانه رحم، ویروس پاپیلومای انسانی |
|
| عنوان انگلیسی |
Bioinformatics Prediction of miRNAs Targeting E6 and E7 Genes in Human Papillomavirus Types 16 and 18 in Cervical Cancer |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background and Aim: Cervical Cancer (CC) is the third most common malignancy in the women, the main cause of which is human papillomavirus (HPV). Both E6 and E7 oncogenes of the virus play an important role in its tumorigenesis. Today, methods available for screening CC are not capable of detecting the disease at an early stage. Therefore, it is important to identify new biomarkers for early detection of this cancer. For this purpose, in the present study, miRNAs targeting the two oncogenes E6 and E7 of human papillomavirus (types 16 and 18) were studied in CC by bioinformatics. Methods & Materials: First, using the NCBI database, the E6 and E7 gene sequences were obtained for both human papillomavirus types 16 and 18. Then, using the miRBase and RNA22 bioinformatics databases, the most appropriate targeting miRNAs for these genes were selected. Ethical Considerations: This study was approved by Ethics Committee of Arak University of Medical Sciences. Results: Based on the P obtained from bioinformatics databases, miRNA including miR-92a-5p (P=7.51e-2), miR-195-3p (P=2.24e-1), miR-34a-5p (P=2.73e-1) and miR-155-5p (P=4.95e-2) were introduced for the two genes E6 and E7. Conclusion: Results from bioinformatics studies revealed that of the four miRNAs identified, miR-155-5p and miR-92a-5p are probably the targeting miRNAs specific for the E6 and E7 genes, respectively. Therefore, it seems that these miRNAs can be a suitable candidate for in vitro studies in CC patients. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
Bioinformatics databases, miRNA, Cervical cancer, Human papillomavirus |
|
| نویسندگان مقاله |
طاهره عظیمی | Tahere Azimi
Department of Biotechnology and Molecular Medicine, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
گروه زیست فناوری و پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم‌پزشکی اراک، اراک، ایران.
ملیحه باقری | Malihe Bagheri
Department of Biotechnology and Molecular Medicine, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
گروه زیست فناوری و پزشکی مولکولی، دانشگاه علوم‌پزشکی اراک، اراک، ایران.
مهدی پریان | Mahdi Pariyan
Department of Research and Development, Production and Research Complex, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran.
بخش تحقیق و توسعه، مجتمع تولیدی و تحقیقاتی انستیتوپاستور ایران، تهران، ایران.
بهزاد خوانساری نژاد | Behzad Khansarinejad
Department of Microbiology and Immunology, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
گروه میکروب شناسی و ایمنی شناسی، دانشگاه علوم‌پزشکی اراک، اراک، ایران.
اشرف زمانی | Ashraf Zamani
Department of Obstetrics and Gynecology, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
گروه زنان و زایمان، دانشگاه علوم‌پزشکی اراک، اراک، ایران.
مهدیه موندنی زاده | Mahdieh Mondanizadeh
Molecular and Medical Research Center, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran.
مرکز تحقیقات پزشکی و مولکولی، دانشگاه علوم‌پزشکی اراک، اراک، ایران.
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3686-3&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
علوم پایه |
| نوع مقاله منتشر شده |
پژوهشی اصیل |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|