|
، جلد ۲۱، شماره ۲، صفحات ۱۷۶-۱۹۳
|
|
|
عنوان فارسی |
مروری بر بررسی های بیوانفورماتیکی عملکرد پروتئین های ساختاری، غیرساختاری و سطح گلیکوپروتئین مهارکننده متابولیسیم پروتئین هِم توسط کرونا ویروس |
|
چکیده فارسی مقاله |
زمینه و هدف ذا تالریه کووید- 19 یک عفونت حاد تنفسی ناشی از ویروس کرونای جدید است. این ویروس، یک RNA ویروس باهمولوژی بالا با کرونا-ویروس خفاش است.روش بررسی در این مطالعه مروری، ابتدا ویژگ یهایسلولی مولکولی، تکثیر و همانن دسازیویروس کرونای جدید بررسی شده و سپسبه کمک مطالعات بیوانفورماتیکی انجام شده درخصوص تحلیل دامین حفاظ ت شده ویروس، مد لسازی همولوژی، داکینگ مولکولیو نق شهای زیستی برخی از پروتئی نهای خاص ویروس کرونای جدید بررسی شد. ORF8 و گلیکوپروتئین سطحی ب هترتیب م یتوانندبه پورفرین متصل شوند. ORF1ab ،ORF10 و ORF3a م یتوانند با پروتئین هِم روی زنجیره 1 - بتا در هموگلوبین هماهنگ شوند تاآهن را تجزیه و پورفرین را شکل دهند. این حمله باعث کاهش هموگلوبینی که اکسیژن و د یاکسید کربن را حمل م یکند،م یشود ودرنتیجه سلو لهای ریه ب هعلت ناتوانی در مبادله کرب ند یاکسید و اکسیژن ملتهب م یشود. التهاب سلو لهای ریه منجر به تصاویر بزرگتوده مانند در در تصویربرداری سی-تی اسکن م یشوند.یافت هها ب اتوج هبه تحلیل نتایج بیوانفورماتیکی، کلروکین م یتواند از عملکرد ORF1ab، ORF10 و ORF3a برای حمله به هموگلوبین)برای تشکیل پورفرین( جلوگیری کند. درنتیجه، تا حد معینی مانع از اتصال ORF8 و گلیکوپروتئی نهای سطحی به پورفرین م یشود.بدی نترتیب، کلروکین م یتواند ب هطور مؤثر علائم حاد تنفسی را تسکین دهد.نتیج هگیری باتوج هبه هم هگیری کنونی،پژوهندگان براین باور هستند که نتایج تحقیقات بیوانفورماتیکی در پیشگیری از شیوع ذا تالریهویروس کرونا، توسعه داروها و واکس نها و درمان بالینی، ارزش بالایی دارند. |
|
کلیدواژههای فارسی مقاله |
ویروس کرونا، روتئین غیرساختاری، گیلکوپروتئین، ٬O RF8 بیوانفورماتیک، |
|
عنوان انگلیسی |
A Review of Bioinformatics Studies on the Function of Structural and Nonstructural Proteins and the Level of Glycoprotein Inhibiting Heme Metabolism by SARS-CoV-2 Virus |
|
چکیده انگلیسی مقاله |
Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is an acute respiratory infection. Its virus called SARS-COV-2 whichis an RNA virus with high homology to the bat coronavirus. In this review study, first the molecular andcellular characteristics and the proliferation and replication of SARS-COV-2 are investigated. Then, by reviewingbioinformatics studies regarding protected domain analysis, homology modeling, and moleculardocking, the biological role of some specific SARS-COV-2 proteins are examined. The results showed thatthe open reading frame 8 (ORF8) and surface glycoprotein could bind to porphyrin. At the same time,ORF1ab, ORF10, and ORF3a can attack the heme part of hemoglobin to dissociate iron and form porphyrin.This attack reduces hemoglobin ability to carry oxygen and carbon dioxide. As a result, lung cellsbecome severely inflamed due to their inability to exchange carbon dioxide and oxygen, which leads tolarge ground-glass opacities on CT scan images. Based on the bioinformatics results, chloroquine canprevent ORF1ab, ORF3a, and ORF10 from attacking hemoglobin to form porphyrin and avoid the bindingof ORF8 and surface glycoprotein to porphyrin, which effectively relieves the symptoms of acute respiratorysyndrome. In the current pandemic, bioinformatics studies are of great importance for preventingthe spread of COVID-19, developing drugs and vaccines, and clinical practice. |
|
کلیدواژههای انگلیسی مقاله |
ویروس کرونا, روتئین غیرساختاری, گیلکوپروتئین, ٬O RF8 بیوانفورماتیک |
|
نویسندگان مقاله |
توحید پیری قراقیه | گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاداسلامی، شهرکرد، ایران
شیدا بیرانوند | گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاداسلامی، شهرکرد، ایران
امیرحسین قدیری | گروه زیست شناسی،
دانشکده علوم پایه، واحد رشت، دانشگاه آزاد اسلامی، رشت، ایران
سامه حاجی محمدی | گروه زیست شناسی،
دانشکده علوم پایه، واحد رشت، دانشگاه آزاد اسلامی، رشت، ایران
|
|
نشانی اینترنتی |
https://jsmj.ajums.ac.ir/article_159519_a4c3f7784fd8ef888af926e58c36b3d9.pdf |
فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
کد مقاله (doi) |
|
زبان مقاله منتشر شده |
fa |
موضوعات مقاله منتشر شده |
|
نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|