، جلد ۲۱، شماره ۶، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی بررسی کتابخانه ای از ریزمولکولهای جدید و موثر با منشاء گیاهی در درمان بیماری کووید ۱۹ با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی از جمله داکینگ مولکولی
چکیده فارسی مقاله امروزه نرخ مرگ و میر بالای بیماری کرونا باعث شده است تا محققان تمرکز بیشتری روی شناسایی داروهای ضد ویروسی کارآمد از بین داروهای موجود داشته باشند. در این میان، استفاده از ریز مولکول هایی با منشا گیاهی به دلیل ایمنی بالاتر ، و مقرون به صرفه بودن مورد توجه قرار گرفته است. ما در این مطالعه با استفاده ازداکینگ مولکولی، به شناسایی بازدارنده های پروتئین 3cl protease و ACE-2 پرداخته ایم. روش کار: بدین منظور، 1600 ترکیب با منشا طبیعی با استفاده از یک غربالگری مجازی مورد بررسی قرار گرفتند. در این روش لیگاندهایی با تمایل بالا نسبت به رزیدوهای جایگاه فعال پروتئینهای هدف با استفاده از Glide Dockingشناسایی شدند تا برای محاسبات بیشتر بر اساس روش القای قالب (Induced fit Docking) با استفاده از نرم افزار شرودینگر مورد تجزیه و تحلیل قرار بگیرند.یافته ها: یافته ها نشان می دهد که ترکیبات بدست آمده با دارا بودن میل اتصال بالا به گیرنده های مذکور می توانند در مهار ویروس کرونا موثر باشند. همچنین ترکیبات معرفی شده در مقایسه با داروهای شناخته شده نظیر کلروکوئین، دارای انرژی اتصال بهتر و اثر مهار کنندگی قابل توجهی هستند.نتیجه گیری: داده های ارائه شده در این مقاله می توانند برای پیشرفت بیشتر در کشف دارو یا فرمولاسیون های جدید برای مقابله با ویروس کرونا کمک کننده باشند اما به آزمایش های بالینی نیاز است تا پتانسیل مولکولهای کوچک فوق الذکر را به تنهایی یا به صورت ترکیبی برای کاربردهای پزشکی بررسی کند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله ویروس کرونا، داکینگ مولکولی، غربالگری مجازی، ترکیبات طبیعی،
عنوان انگلیسی In silico structural-based virtual screening and molecular docking analysis of natural-based small molecules against SARS-CoV-2
چکیده انگلیسی مقاله Background: Today, despite many studies on coronavirus, there is still a high rate of disease mortality, which has prompted researchers to focus more on finding successful antiviral drugs among the available drugs. Among them, small-molecule inhibitors have been suggested as the best candidates due to their physicochemical properties with higher safety, lower toxicity, and cost-effectiveness. Methods: Here, we applied a bioinformatics approach using virtual screening of 1,600 natural products to identify the prospective inhibitors of 3cl protease and ACE-2 receptors. In this method, ligands with a high affinity for active site residues of target proteins have identified using Glide Docking to evaluated for further calculations based on the Induced Fit Docking method using Schrödinger-Maestro software.findings: The findings suggest that resultant compounds with high receptor binding affinity can be effective in suppressing coronaviruses. In comparison, the introduced compounds have higher binding energy and a potent inhibitory effect relative to known drugs such as chloroquine. Conclusion: The evidence provided in this paper may help to further the development of new drugs or formulations to combat coronavirus, but clinical trials are required to examine the potential of these small molecules alone or in combination for medical applications.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله ویروس کرونا, داکینگ مولکولی, غربالگری مجازی, ترکیبات طبیعی
نویسندگان مقاله زهرا آزادیان |
گروه بیوتکنولوژی و سلولی مولکولی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران آزمایشگاه طب بازساختی و نوآوری موقعیت

علیرضا فتاح پور |
گروه بیوتکنولوژی و سلولی مولکولی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران آزمایشگاه طب بازساختی و نوآوری

مرضیه سلیمانی |
گروه بیوتکنولوژی و سلولی مولکولی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران آزمایشگاه طب بازساختی و نوآوری

کیهان آزادمنش |
گروه ویروس شناسی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران

عاطفه علیپور |
گروه نانوبیوتکنولوژی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران

حسین شاهسوارانی |
گروه بیوتکنولوژی و سلولی مولکولی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران آزمایشگاه طب بازساختی و نوآوری

نشانی اینترنتی https://jsmj.ajums.ac.ir/article_172888_aa9dcbc56f7ff1e9a9b6e6fa466d5779.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات