، جلد ۱۱، شماره ۱، صفحات ۸۵-۹۵

عنوان فارسی بررسی میزان کارآیی روش Real-Time PCR با استفاده از دو راهکار رسم منحنی استاندارد و رگرسیون خطی
چکیده فارسی مقاله زمینه و هدف: آنالیز کمّی mRNA با استفاده از Real-Time PCR به­وسیله روش سایبرگرین به­طور وسیعی در مطالعات بیولوژیک کاربرد بسیاری پیدا کرده است. هدف این تحقیق مقایسه کارآیی P‏CR محاسبه شده با استفاده از دو روش شیب خط نمودار استاندارد و نرم­افزارLinRegPCR جهت تعیین استراتژی بهتر برای محاسبه کارآیی PCR می­باشد. روش بررسی: در این پژوهش پس از خون­گیری و استخراج RNA و سنتز cDNAفرآیند qRT-PCR انجام شد.سپس محاسبه PCR Efficiency به دو روش رسم منحنی استاندارد و همچنین با استفاده از نرم­افزارLinReg PCR انجام گرفت و در نهایت این دو روش آنالیز با هم مقایسه شدند. یافته­ها: میزان کارآیی PCR محاسبه شده برای سه ژنGAPDH، TGF βو IL-10 با روش منحنی استاندارد به­ترتیب 99/1، 81/1 و 87/1 و همچنین با روش استفاده از نرم­افزار رایانه­ای LinReg PCR کارآیی این سه ژن به­ترتیب 98/1، 82/1 و82/1 به­دست آمد. نتیجه­گیری: نتایج این تحقیق نشان می­دهد که در آنالیز داده­های حاصل از تکثیر cDNA میزان کارآیی P‏CR به­دست آمده برای سه ژن GAPDH، TGF β و IL-10با دو روش مختلف منحنی استاندارد و LineRegPCR نتایج تقریباً یکسانی حاصل می­شود. بنابراین، توصیه می­شود که به­جای روش پرهزینه منحنی استاندارد از نرم­افزار LinReg PCR استفاده گردد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله Real-Time PCR، PCR Efficiency، سایبرگرین، نرم‌افزارLinReg PCR،

عنوان انگلیسی Evaluation of Real-Time PCR Efficiency by the Use of Two Strategies: Standard Curve and Linear Regression
چکیده انگلیسی مقاله Background and Objective: The detection of nucleic acids using Real-Time CPR has many application .Quantitative analysis of mRNA using Real-Time PCR by Relative and Absolute methods. Widely used in biological studies. The purpose of this study was to compare the Relative and calculated PCR Efficiency by standard curve and LinRegPCR methods. Subject and Methods: After sampling and extraction of RNA and cDNA synthesis,the quantitative RT-PCR was performed, then the PCR Efficiency was calculated by Using the two methods of standard curve and LinRegPCR. At the end the results of the two methods were compared and analyzed. Results: The efficiency of PCR for the GAPDH, TGF-β and IL-10 genes with the standard curve method were 1.99, 1.81 and 1.87, respectively. The PCR efficiency of these three genes were 1.98, 1.82 and 1.82 by using LinRegPCR software method, respectively. Conclusion: The analysis of the data obtained from PCR proliferation of cDNA of the three genes, GAPDH, TGF β and IL-10 showed no statistical difference between standard curve and LineRegPCR methods. Therefore, it is recommended to use the LinRegPCR software method instead of the expensive standard curve method.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Real-Time PCR, PCR Efficiency, سایبرگرین, نرم‌افزارLinReg PCR

نویسندگان مقاله علی خدادادی |
استادیار گروه ایمونولوژی.گروه ایمونولوژی و مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.

مریم حمیدی‌نیا |
دانشجوی کارشناس ارشد گروه ایمونولوژی.گروه ایمونولوژی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.

مهری غفوریان |
دانشیار گروه ایمونولوژی.گروه ایمونولوژی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.

جواد محمدی‌اصل |
استادیار گروه ژنتیک پزشکی.گروه ژنتیک پزشکی و مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، دانشکدة پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جندی‌شاپور اهواز، ایران.


نشانی اینترنتی https://jsmj.ajums.ac.ir/article_49448_fed2d0af7241ac5d572097eb647d4be7.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات