|
|
، جلد ۱۰، شماره ۱، صفحات ۳۳-۴۰
|
|
|
| عنوان فارسی |
تنوع ژنتیکی جدای های اشریشیا کلی از انسان و گوساله ها به روش RAPD-PCR |
|
| چکیده فارسی مقاله |
سویه‌های مختلف اشریشیا کلی به عنوان عوامل مهم عفونت‌های داخل و خارج روده‌ای در انسان و گونه‌های مختلف دامی شناخته می‌شوند. روش‌های مولکولی، برای شناسایی جدایه‌های باکتریایی، تنوع سکانس نوکلئوتیدی، اطلاعاتی در زمینه ردیابی عوامل باکتریایی دخیل در همه گیری‌ها، شناسایی تکراردر ساختار ژنتیکی و نیز شناسایی تکامل تدریجی باکتری‌ها، اهمیت دارند. هدف: هدف از این مطالعه ارزیابی میزان کارایی روش RAPD-PCR در تفکیک جدایه‌های اشریشیا کلی می‌باشد. روش‌کار: در این مطالعه 110 جدایه اشریشیا کلی از منابع مختلف به کمک دو الیگونوکلئوتید bp10 با سکانس‌های اختیاری به روش RAPD-PCR مورد بررسی قرار گرفتند. این جدایه‌ها از افراد مبتلا به عفونت ادراری، گوساله‌های نوزاد مبتلا به اسهال یا سپتی سمی، جدا شده بودند. نتایج: تجزیه و تحلیل اطلاعات نشان داد که 5/87٪ ازجدایه‌های اشریشیا کلی جدا شده از انسان به درستی در گروه میزبان انسان طبقه‌بندی شدند، درحالی که 3/94٪ از جدایه‌های اشریشیا کلی به درستی در گروه‌های مربوط به گوساله قرار گرفتند. همچنین نشان داده شد که 100٪ و 3/93٪ از جدایه‌ها به درستی به ترتیب درگروه‌های گوساله اسهالی وسپتی سمی قرار گرفتند. نتیجه‌گیری‌نهایی: آنالیز تنوع ژنتیکی نشان داد که درصد پلی مورفیسم در بین جدایه‌های اشریشیا کلی از افراد مبتلا به عفونت ادراری، گوساله‌های مبتلا به اسهال و گوساله‌های سپتی سمی به ترتیب 71/54٪، 22/61٪ و 5/62 ٪ بودند. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
Genetic variation among Escherichia coli isolates from human and calves by using RAPD PCR |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Background: Various strains of Escherichia coli (E. coli) are known as major causes of intestinal and extraintestinal infections in humans and various animal species. Molecular methods are important for the identification of bacterial isolates and nucleotide sequence variations, as well as information on tracking bacterial agents related to the outbreaks, the frequency of the bacterial genetic structure, and the evolution of microbial populations. Objectives: The purpose of the present study was to evaluate the efficiency of the RAPD method to differentiate E. coli strains. Methods: In this study, 110 isolates of E. coli were analyzed by the RAPD PCR method using two 10bp oligonucleotides. These strains were isolated from humans with urinary tract infections and neonatal calves affected by diarrhea or septicemia. Results: Data analysis showed that 87.5% of human E. coli isolates were correctly classified in the human host group, while 94.3% of calf E. coli isolates were correctly placed in calf groups. It also demonstrated that 100% and 93.3% of isolates were accurately assigned to diarrheic and septicemic calf groups, respectively. ConclusionS: Genetic variation analysis indicated that the percentage of polymorphism among E. coli isolates from humans with urinary tract infections, diarrheic calves, and septicemic neonatal calves were 54.71%, 61.22%, and 62.5%, respectively. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
E. coli,Genetic variation,RAPD-PCR |
|
| نویسندگان مقاله |
Asma Afshari |
Department of Pathobiology, School of Veterinary Medicine, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
Mehrnaz Rad |
Department of Pathobiology, School of Veterinary Medicine, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
Hesamedin Seifi |
Center of Excellence in Ruminant Abortion and Neonatal Mortality and Department of Clinical Sciences, School of Veterinary Medicine, Ferdowsi Unversity of Mashhad, Mashhad, Iran
Kiarash Ghazvini |
Antimicrobial Resistance Research Center, Faculty of Medicine, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran
|
|
| نشانی اینترنتی |
https://ijvm.ut.ac.ir/article_57048_2bc6baf424edd257c967d90f43b15a75.pdf |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
en |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
|
| نوع مقاله منتشر شده |
|
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|